מחלה כרונית, בניגוד למחלה חריפה חולפת, מהווה אתגר גדול לחולה, לבני משפחתו ולצוות הרפואי. מחלות כרוניות של מערכת העיכול והכבד מערבות לא רק את מערכת העיכול אלא גם מערכות מחוץ למערכת העיכול, כמו עיניים, פרקים, עור, אלרגיה, ריאות, אא"ג, מח ונפש. הגישה הטיפולית בחולים אלו מורכבת ומבוססת על ניהול כולל של המחלה בשילוב טיפול בקהילה בתקופות רגיעה ובבית חולים בזמן החמרה והתקף.
